Достаточно было Республике продолжить своё наступление сразу после удара по Геонозису, и велика вероятность, Конфедерация была бы смята раньше, чем успела бы укрепить свои позиции. Однако существовала одна, явно бросающаяся в глаза загвоздка: Республика не была готова к войне. Ещё не все клоны покинули пробирки и новые корабли ещё не сошли со стапелей: Республике просто не хватало ресурсов, чтобы вести войну в галактическом масштабе.

Тем временем Конфедерация рассредоточила свои силы по всем крупнейшим гиперлиниям в сепаратистском пространстве, укрепив свою оборону. У Республики не осталось другого выбора, кроме как временно положиться на тактику изнуряющих набегов; тем самым скорый конец войны остался несбывшейся мечтой.

Победы не всегда приходили только на поле боя. На изоляционистской Кореллии, Джедай-твилек Аайла Секура и Джедай-Каамаси Иленик Ит’кла помогли ученому Техносоюза перейти под защиту Республики. Неожиданная помощь пришла от кореллианского Мастера Джедая Неджаа Халсион, недавно вернувшегося с неудачной миссии остановить беспредел Сынов Свободы в секторе Слуйс.
Атракен, мир Конфедерации, был богат редким металлом дунием. Освобождение Атракена от врага займет почти год, и кажущаяся тщетность утилий приведет к тому, что многие джедаи станут считать неправильным свое участие в такой нигилистической войне.